清水祖师庙位于三峡镇中心，创建于清干隆34年，在道光13年时因地震损毁而重建。到1895年时又惨遭日军焚毁，四年后在地方士绅筹画下二度重建。第三次则在台湾光复后，由艺术家李梅树先生主导设计规划，他主张祖师庙该成为一座融合中国历史、文化和寺庙艺术的庙宇，同时因其本身的西画素养，使祖师庙又加入了西洋美术的色彩。此次工程自民国36年开始，至今仍在进行中。
庙内供奉清水祖师，平日香火鼎盛，与万华龙山寺、大龙峒保安宫并称北市三大寺庙。祖师庙的精致讲究的雕工，闻名全台，因而?quot;东方艺术殿堂"之美名，已成为全台湾庙宇建筑的经典之作。
【清水祖师小百科】
清水祖师，姓陈，名昭应，法号「普足」，公元 1044 年 ( 宋元宗 22 年 ) 生于福建永春县小姑乡。年少得道，又精通医术，救人无数，常募捐修桥铺路， 又能祈雨救灾，后隐居于安溪清水岩，65 岁羽化升天。乡民感戴其德，奉祀塑像， 是为「清水祖师」。 亦被敕封为「显应真人」。
台湾清水祖师庙，以三峡祖师庙最悠久（创建于 1769 年，干隆 34 年），亦最著名，尤其李梅树教授主导下重建，使三峡祖师庙有东方艺术殿堂之称。
万华祖师庙则创建于 1790年，至今仍是台北市三大寺庙知一。而清水祖师庙则以景点极佳， 可以远眺淡水河和观音山，以及「清法战争」时的神迹著称。庙中有光绪帝所颁「功资拯济」匾额。

交通路线：

自行开车：
由台北循３号省道前行，经板桥．土城至三峡；由台北至此约27.5公里。